Con la modalità Conquest, sono apparsi nuovi NPC, su alcuni pianeti, negli avamposti di ogni fazione.
Ogni slot può avere un Commander (3500K HP o un Veteran Battlemaster (571K HP). Si trovano negli avamposti nemici, quindi sarai etichettato come PvP.
Una volta sconfitto, ogni membro del party riceve un "Flagship Blueprint: Encoding" e il Comandante ha anche la possibilità di rilasciare un "Flagship Blueprint", utilizzato per sbloccare le monete nella nave.
I comandanti si rigenerano dopo 3 ore, ma hanno uno scudo su di loro che li rende immuni ai danni, che dura per 6 ore o quando la gilda che controlla il pianeta li ha bombardati, disabilitando il loro scudo. Questo bombardamento, chiamato "Flagship: Galactic Hunter Parade", può essere acquistato dalla flotta, dal Planetary Conquest Gear NPC, per 1 Dark Project.
Ecco l'elenco dei comandanti con le loro posizioni:
Tatooine
Avamposto di Zaroshe, Il mare delle dune
Alderande
Avamposto di Talarn, Monti Juran
Quesh
Guarnigione imperiale
Hoth
Avamposto Frozen Wake (Gelvif), Cimitero spaziale
Belsavis
Posto di comando imperiale, settore di alta sicurezza
Voss
Avamposto del soprintendente, periferia di Pelath-Ri
Corellia
Settore commerciale, distretto governativo
Ilum
