Con la modalità Conquest, sono apparsi nuovi NPC, su alcuni pianeti, negli avamposti di ogni fazione.
Ogni posizione può avere un Comandante (5 milioni di HP o un Veteran Battlemaster (800K HP). Si trovano negli avamposti nemici, quindi sarai etichettato come PvP.
Una volta sconfitto, ogni membro del party riceve un "Flagship Blueprint: Encoding", e il Comandante ha anche la possibilità di rilasciare un "Flagship Blueprint", utilizzato per sbloccare monete nella nave (massimo 12 progetti per. Comandante).
I comandanti si rigenerano dopo 3 ore, ma hanno uno scudo che li rende immuni ai danni (non i Battlemasters), che dura 6 ore o quando la gilda che controlla il pianeta li ha bombardati, disabilitando il loro scudo. Questo bombardamento, chiamato "Flagship: Galactic Hunter Parade", può essere acquistato dalla flotta, dal Planetary Conquest Gear NPC, per 1 Dark Project.
Ecco l'elenco dei comandanti con le loro posizioni:
Tatooine
Avamposto di Thorazan, Mare di Dune
Alderande
Circolo di Commercio, Col du Roi
Quesh
Campo minerario della Repubblica
Hoth
Avamposto di Zerek, cimitero spaziale
Belsavis
Torre di Guardia della Repubblica, settore di alta sicurezza
Voss
Avamposto di Kri-Ta, periferia di Pelath-Ri
Corellia
Stazione dei tram nord, distretto governativo
Ilum
Campo base della Repubblica, strato di ghiaccio occidentale
